API tools faq
paste
Advertisement
temaon_lieto

Api::V1::DiseaseProgresses::PatientsController#index

temaon_lieto
Jun 14th, 2024 (edited)
198
0
Never
Add comment
Not a member of Pastebin yet? Sign Up, it unlocks many cool features!
PostgreSQL 24.90 KB | None | 0 0
raw download clone embed print report
  1. SELECT *
  2. FROM (WITH "items" AS (SELECT mv_stat_lvl_2_joined_items.id,
  3.                               mv_stat_lvl_2_joined_items.asserted_date,
  4.                               mv_stat_lvl_2_joined_items.code,
  5.                               mv_stat_lvl_2_joined_items.item_type,
  6.                               mv_stat_lvl_2_joined_items.status::varchar,
  7.                               mv_stat_lvl_2_joined_items.title,
  8.                               mv_stat_lvl_2_joined_items.employee_id,
  9.                               mv_stat_lvl_2_joined_items.legal_entity_id,
  10.                               mv_stat_lvl_2_joined_items.patient_id
  11.                        FROM "mv_stat_lvl_2_joined_items"
  12.                        WHERE "mv_stat_lvl_2_joined_items"."asserted_date" BETWEEN '2024-01-01 00:00:00' AND '2024-06-14 23:59:59.999999'
  13.                          AND "mv_stat_lvl_2_joined_items"."legal_entity_id" = 8575),
  14.            "main_counters" AS (SELECT COALESCE(COUNT(DISTINCT mv_stat_lvl_1_declarations.id), 0) AS counter,
  15.                                       mv_stat_lvl_1_declarations.patient_id                      AS patient_id,
  16.                                       CASE
  17.                                           WHEN (("mv_stat_lvl_1_patients"."gender" = 1 AND DATE_PART('YEAR',
  18.                                                                                                      AGE('2024-06-14 23:59:59.999999', mv_stat_lvl_1_patients.birth_date)) BETWEEN 50 AND 999) OR
  19.                                                 ("mv_stat_lvl_1_patients"."gender" = 0 AND DATE_PART('YEAR',
  20.                                                                                                      AGE('2024-06-14 23:59:59.999999', mv_stat_lvl_1_patients.birth_date)) BETWEEN 40 AND 999))
  21.                                               THEN
  22.                                               CASE
  23.                                                   WHEN (COUNT(DISTINCT items.code) filter (WHERE "items"."code" IN
  24.                                                                                                  ('T34006', 'T34011',
  25.                                                                                                   'T34013', 'T34024',
  26.                                                                                                   'T34001',
  27.                                                                                                   'T34004'))) > 0
  28.                                                       THEN 'done'
  29.                                                   ELSE 'need_done'
  30.                                                   END
  31.                                           ELSE
  32.                                               'no_need_done'
  33.                                           END                                                       hypertension_state,
  34.                                       CASE
  35.                                           WHEN (DATE_PART('YEAR',
  36.                                                           AGE('2024-06-14 23:59:59.999999', mv_stat_lvl_1_patients.birth_date)) BETWEEN 45 AND 999)
  37.                                               THEN
  38.                                               CASE
  39.                                                   WHEN (COUNT(DISTINCT items.code)
  40.                                                         filter (WHERE "items"."code" IN ('T34005', 'T34023', 'T34025', 'T34038', '14743-9'))) >
  41.                                                        0 THEN 'done'
  42.                                                   ELSE 'need_done'
  43.                                                   END
  44.                                           ELSE
  45.                                               'no_need_done'
  46.                                           END                                                    AS diabetes_state,
  47.                                       CASE
  48.                                           WHEN ("mv_stat_lvl_1_patients"."gender" = 0 AND (DATE_PART('YEAR',
  49.                                                                                                      AGE('2024-06-14 23:59:59.999999', mv_stat_lvl_1_patients.birth_date)) BETWEEN 50 AND 999))
  50.                                               THEN
  51.                                               CASE
  52.                                                   WHEN (COUNT(DISTINCT items.code)
  53.                                                         filter (WHERE "items"."code" IN ('U67002', 'Y34011', 'Y34003'))) >
  54.                                                        0 THEN 'done'
  55.                                                   ELSE 'need_done'
  56.                                                   END
  57.                                           ELSE
  58.                                               'no_need_done'
  59.                                           END                                                    AS prostate_cancer_state,
  60.                                       CASE
  61.                                           WHEN ("mv_stat_lvl_1_patients"."gender" = 1 AND (DATE_PART('YEAR',
  62.                                                                                                      AGE('2024-06-14 23:59:59.999999', mv_stat_lvl_1_patients.birth_date)) BETWEEN 50 AND 69))
  63.                                               THEN
  64.                                               CASE
  65.                                                   WHEN (COUNT(DISTINCT items.code) filter (WHERE "items"."code" IN
  66.                                                                                                  ('Х41941', 'X41973',
  67.                                                                                                   '59300-00',
  68.                                                                                                   '55070-00',
  69.                                                                                                   '55076-00'))) > 0
  70.                                                       THEN 'done'
  71.                                                   ELSE 'need_done'
  72.                                                   END
  73.                                           ELSE
  74.                                               'no_need_done'
  75.                                           END                                                    AS breast_cancer_state,
  76.                                       CASE
  77.                                           WHEN (DATE_PART('YEAR',
  78.                                                           AGE('2024-06-14 23:59:59.999999', mv_stat_lvl_1_patients.birth_date)) BETWEEN 50 AND 75)
  79.                                               THEN
  80.                                               CASE
  81.                                                   WHEN (COUNT(DISTINCT items.code) filter (WHERE "items"."code" IN
  82.                                                                                                  ('D36003', 'D67006',
  83.                                                                                                   '32084-00',
  84.                                                                                                   '32090-00',
  85.                                                                                                   '32084-02',
  86.                                                                                                   '32090-02'))) > 0
  87.                                                       THEN 'done'
  88.                                                   ELSE 'need_done'
  89.                                                   END
  90.                                           ELSE
  91.                                               'no_need_done'
  92.                                           END                                                    AS colorectal_cancer_state,
  93.                                       CASE
  94.                                           WHEN (DATE_PART('YEAR',
  95.                                                           AGE('2024-06-14 23:59:59.999999', mv_stat_lvl_1_patients.birth_date)) BETWEEN 14 AND 999)
  96.                                               THEN
  97.                                               CASE
  98.                                                   WHEN (COUNT(DISTINCT items.code)
  99.                                                         filter (WHERE "items"."code" IN ('B33006', 'B33012'))) > 0
  100.                                                       THEN 'done'
  101.                                                   ELSE 'need_done'
  102.                                                   END
  103.                                           ELSE
  104.                                               'no_need_done'
  105.                                           END                                                    AS hiv_state
  106.                                FROM "mv_stat_lvl_1_declarations"
  107.                                         JOIN mv_stat_lvl_1_patients ON mv_stat_lvl_1_patients.legal_entity_id =
  108.                                                                        mv_stat_lvl_1_declarations.legal_entity_id AND
  109.                                                                        mv_stat_lvl_1_patients.id =
  110.                                                                        mv_stat_lvl_1_declarations.patient_id
  111.                                         LEFT JOIN items ON items.legal_entity_id =
  112.                                                            mv_stat_lvl_1_declarations.legal_entity_id AND
  113.                                                            items.patient_id = mv_stat_lvl_1_declarations.patient_id
  114.                                WHERE "mv_stat_lvl_1_declarations"."legal_entity_id" = 8575
  115.                                GROUP BY mv_stat_lvl_1_declarations.patient_id, mv_stat_lvl_1_patients.birth_date,
  116.                                         mv_stat_lvl_1_patients.gender),
  117.            "diagnoses" AS (SELECT mv_stat_lvl_1_reception_conditions.patient_id, mv_stat_lvl_1_reception_conditions.code
  118.                            FROM "mv_stat_lvl_1_reception_conditions"
  119.                            WHERE "mv_stat_lvl_1_reception_conditions"."asserted_date" BETWEEN '2024-01-01 00:00:00' AND '2024-06-14 23:59:59.999999'
  120.                              AND "mv_stat_lvl_1_reception_conditions"."legal_entity_id" = 8575),
  121.            "observations" AS (SELECT mv_stat_lvl_1_ehr_observations.patient_id, mv_stat_lvl_1_ehr_observations.code
  122.                               FROM "mv_stat_lvl_1_ehr_observations"
  123.                               WHERE "mv_stat_lvl_1_ehr_observations"."asserted_date" BETWEEN '2024-01-01 00:00:00' AND '2024-06-14 23:59:59.999999'
  124.                                 AND "mv_stat_lvl_1_ehr_observations"."legal_entity_id" = 8575
  125.                                 AND "mv_stat_lvl_1_ehr_observations"."code" IN
  126.                                     ('39156-5', '14743-9', '8462-4', '8480-6', '56086-2', '4548-4', '14647-2')),
  127.            "diagnosis_cnt" AS (SELECT diagnoses.patient_id,
  128.                                       COUNT(DISTINCT diagnoses.code)                                              AS diagnoses_c1_64_counter,
  129.                                       COUNT(DISTINCT diagnoses.code)
  130.                                       filter (WHERE "diagnoses"."code" IN ('A98'))                                AS diagnoses_a98_counter,
  131.                                       COUNT(DISTINCT diagnoses.code)
  132.                                       filter (WHERE "diagnoses"."code" IN ('K86', 'K87'))                         AS diagnoses_c1_65_counter,
  133.                                       COUNT(DISTINCT diagnoses.code)
  134.                                       filter (WHERE "diagnoses"."code" IN ('K76', 'K74'))                         AS diagnoses_c2_65_counter,
  135.                                       COUNT(DISTINCT diagnoses.code)
  136.                                       filter (WHERE "diagnoses"."code" IN ('T89', 'T90'))                         AS diagnoses_c3_65_counter
  137.                                FROM diagnoses
  138.                                GROUP BY "diagnoses"."patient_id"
  139.                                HAVING (COUNT(DISTINCT diagnoses.code) > 0)),
  140.            "observations_cnt" AS (SELECT observations.patient_id,
  141.                                          COUNT(DISTINCT observations.code)
  142.                                          filter (WHERE "observations"."code" IN ('14647-2'))          AS cholesterol_obs_counter,
  143.                                          COUNT(DISTINCT observations.code) filter (WHERE "observations"."code" IN
  144.                                                                                          ('39156-5', '14743-9',
  145.                                                                                           '8462-4', '8480-6',
  146.                                                                                           '56086-2')) AS observations_c1_64_counter,
  147.                                          COUNT(DISTINCT observations.code) filter (WHERE "observations"."code" IN
  148.                                                                                          ('39156-5', '14743-9',
  149.                                                                                           '8462-4', '8480-6',
  150.                                                                                           '56086-2')) AS observations_c1_65_counter,
  151.                                          COUNT(DISTINCT observations.code) filter (WHERE "observations"."code" IN
  152.                                                                                          ('39156-5', '14743-9',
  153.                                                                                           '8462-4', '8480-6', '56086-2',
  154.                                                                                           '4548-4'))  AS observations_c2_65_counter
  155.                                   FROM observations
  156.                                   GROUP BY "observations"."patient_id"
  157.                                   HAVING (COUNT(DISTINCT observations.code) > 0)),
  158.            "reasons_cnt" AS (SELECT mv_stat_lvl_1_ehr_reasons.patient_id,
  159.                                     COUNT(DISTINCT mv_stat_lvl_1_ehr_reasons.code) AS a98_counter
  160.                              FROM "mv_stat_lvl_1_ehr_reasons"
  161.                              WHERE "mv_stat_lvl_1_ehr_reasons"."code" = 'A98'
  162.                                AND "mv_stat_lvl_1_ehr_reasons"."asserted_date" BETWEEN '2024-01-01 00:00:00' AND '2024-06-14 23:59:59.999999'
  163.                                AND "mv_stat_lvl_1_ehr_reasons"."legal_entity_id" = 8575
  164.                              GROUP BY "mv_stat_lvl_1_ehr_reasons"."patient_id"
  165.                              HAVING (COUNT(DISTINCT mv_stat_lvl_1_ehr_reasons.code) > 0)),
  166.            "reports_cnt" AS (SELECT mv_stat_lvl_0_ehr_diagnostic_reports.patient_id,
  167.                                     COUNT(DISTINCT mv_stat_lvl_0_ehr_diagnostic_reports.code) AS counter
  168.                              FROM "mv_stat_lvl_0_ehr_diagnostic_reports"
  169.                              WHERE "mv_stat_lvl_0_ehr_diagnostic_reports"."code" IN
  170.                                    ('T34001', 'T34006', 'T34024', 'T34011', 'T34013')
  171.                                AND "mv_stat_lvl_0_ehr_diagnostic_reports"."asserted_date" BETWEEN '2024-01-01 00:00:00' AND '2024-06-14 23:59:59.999999'
  172.                                AND "mv_stat_lvl_0_ehr_diagnostic_reports"."legal_entity_id" = 8575
  173.                              GROUP BY "mv_stat_lvl_0_ehr_diagnostic_reports"."patient_id"
  174.                              HAVING (COUNT(DISTINCT mv_stat_lvl_0_ehr_diagnostic_reports.code) > 0)),
  175.            "actions_cnt" AS (SELECT mv_stat_lvl_1_ehr_actions.patient_id,
  176.                                     COUNT(DISTINCT mv_stat_lvl_1_ehr_actions.code) AS counter
  177.                              FROM "mv_stat_lvl_1_ehr_actions"
  178.                              WHERE "mv_stat_lvl_1_ehr_actions"."code" IN ('K45', 'D45', 'T45')
  179.                                AND "mv_stat_lvl_1_ehr_actions"."asserted_date" BETWEEN '2024-01-01 00:00:00' AND '2024-06-14 23:59:59.999999'
  180.                                AND "mv_stat_lvl_1_ehr_actions"."legal_entity_id" = 8575
  181.                              GROUP BY "mv_stat_lvl_1_ehr_actions"."patient_id"
  182.                              HAVING (COUNT(DISTINCT mv_stat_lvl_1_ehr_actions.code) > 0)),
  183.            "groups_counter" AS (SELECT mv_stat_lvl_1_patients.id AS patient_id,
  184.                                        CASE
  185.                                            WHEN (DATE_PART('YEAR',
  186.                                                            AGE('2024-06-14 23:59:59.999999', mv_stat_lvl_1_patients.birth_date)) BETWEEN 40 AND 64)
  187.                                                THEN
  188.                                                CASE
  189.                                                    WHEN (diagnosis_cnt.diagnoses_a98_counter > 0 OR reasons_cnt.a98_counter > 0) AND
  190.                                                         ((reports_cnt.counter > 0 OR observations_cnt.cholesterol_obs_counter > 0) AND
  191.                                                          observations_cnt.observations_c1_64_counter > 0) THEN 'done'
  192.                                                    ELSE 'need_done'
  193.                                                    END
  194.                                            ELSE 'no_need_done'
  195.                                            END                   AS visits_from_40_to_64_state,
  196.                                        CASE
  197.                                            WHEN (DATE_PART('YEAR',
  198.                                                            AGE('2024-06-14 23:59:59.999999', mv_stat_lvl_1_patients.birth_date)) BETWEEN 65 AND 999)
  199.                                                THEN
  200.                                                CASE
  201.                                                    WHEN (diagnosis_cnt.diagnoses_a98_counter > 0 OR reasons_cnt.a98_counter > 0) AND
  202.                                                         ((observations_cnt.cholesterol_obs_counter > 0 OR reports_cnt.counter > 0) AND
  203.                                                          (((diagnosis_cnt.diagnoses_c1_65_counter > 0 OR
  204.                                                             diagnosis_cnt.diagnoses_c2_65_counter > 0) AND
  205.                                                            observations_cnt.observations_c1_65_counter > 0) OR
  206.                                                           (diagnosis_cnt.diagnoses_c3_65_counter > 0 AND
  207.                                                            observations_cnt.observations_c2_65_counter > 0)))
  208.                                                        THEN 'done'
  209.                                                    WHEN (diagnosis_cnt.diagnoses_c1_65_counter > 0 OR
  210.                                                          diagnosis_cnt.diagnoses_c2_65_counter > 0 OR
  211.                                                          diagnosis_cnt.diagnoses_c3_65_counter > 0) THEN 'need_done'
  212.                                                    ELSE 'no_need_done'
  213.                                                    END
  214.                                            ELSE 'no_need_done'
  215.                                            END                   AS visits_upper_65_state
  216.                                 FROM "mv_stat_lvl_1_patients"
  217.                                          LEFT JOIN observations_cnt
  218.                                                    ON mv_stat_lvl_1_patients.id = observations_cnt.patient_id AND
  219.                                                       (observations_cnt.cholesterol_obs_counter > 0 OR
  220.                                                        observations_cnt.observations_c1_64_counter >= 5 OR
  221.                                                        observations_cnt.observations_c1_65_counter >= 5 OR
  222.                                                        observations_cnt.observations_c2_65_counter >= 6)
  223.                                          LEFT JOIN diagnosis_cnt
  224.                                                    ON mv_stat_lvl_1_patients.id = diagnosis_cnt.patient_id AND
  225.                                                       (diagnosis_cnt.diagnoses_c1_64_counter > 0 OR
  226.                                                        diagnosis_cnt.diagnoses_c1_65_counter > 0 OR
  227.                                                        diagnosis_cnt.diagnoses_c2_65_counter > 0 OR
  228.                                                        diagnosis_cnt.diagnoses_c3_65_counter > 0)
  229.                                          LEFT JOIN reasons_cnt ON reasons_cnt.patient_id = mv_stat_lvl_1_patients.id
  230.                                          LEFT JOIN reports_cnt ON reports_cnt.patient_id = mv_stat_lvl_1_patients.id
  231.                                          LEFT JOIN actions_cnt ON actions_cnt.patient_id = mv_stat_lvl_1_patients.id
  232.                                 WHERE "mv_stat_lvl_1_patients"."legal_entity_id" = 8575
  233.                                   AND (diagnosis_cnt.diagnoses_a98_counter > 0 OR reasons_cnt.a98_counter > 0 OR
  234.                                        actions_cnt.counter > 0 OR reports_cnt.counter > 0)
  235.                                 GROUP BY mv_stat_lvl_1_patients.id, mv_stat_lvl_1_patients.age,
  236.                                          mv_stat_lvl_1_patients.birth_date, visits_from_40_to_64_state,
  237.                                          visits_upper_65_state)
  238.       SELECT DISTINCT mv_stat_lvl_1_patients.id,
  239.                       mv_stat_lvl_1_patients.full_name,
  240.                       mv_stat_lvl_1_patients.age,
  241.                       mv_stat_lvl_1_patients.employee_id,
  242.                       mv_stat_lvl_1_patients.gender,
  243.                       mv_stat_lvl_1_patients.full_name,
  244.                       mv_stat_lvl_1_patients.birth_date,
  245.                       mv_stat_lvl_1_patients.legal_entity_id,
  246.                       main_counters.hypertension_state,
  247.                       main_counters.diabetes_state,
  248.                       main_counters.prostate_cancer_state,
  249.                       main_counters.breast_cancer_state,
  250.                       main_counters.colorectal_cancer_state,
  251.                       main_counters.hiv_state,
  252.                       CASE
  253.                           WHEN groups_counter.visits_from_40_to_64_state IS NULL THEN
  254.                               CASE
  255.                                   WHEN DATE_PART('YEAR',
  256.                                                  AGE('2024-06-14 23:59:59.999999', mv_stat_lvl_1_patients.birth_date)) BETWEEN 40 AND 64
  257.                                       THEN 'need_done'
  258.                                   ELSE 'no_need_done'
  259.                                   END
  260.                           ELSE groups_counter.visits_from_40_to_64_state
  261.                           END                                                                            visits_from_40_to_64_state,
  262.                       DATE_PART('YEAR',
  263.                                 AGE('2024-06-14 23:59:59.999999', mv_stat_lvl_1_patients.birth_date)) as current_age,
  264.                       CASE
  265.                           WHEN groups_counter.visits_upper_65_state IS NULL THEN
  266.                               CASE
  267.                                   WHEN DATE_PART('YEAR',
  268.                                                  AGE('2024-06-14 23:59:59.999999', mv_stat_lvl_1_patients.birth_date)) BETWEEN 65 AND 999 AND
  269.                                        (diagnosis_cnt.diagnoses_c1_65_counter > 0 OR
  270.                                         diagnosis_cnt.diagnoses_c2_65_counter > 0 OR
  271.                                         diagnosis_cnt.diagnoses_c3_65_counter > 0) THEN 'need_done'
  272.                                   ELSE 'no_need_done'
  273.                                   END
  274.                           ELSE groups_counter.visits_upper_65_state
  275.                           END                                                                            visits_upper_65_state
  276.       FROM "mv_stat_lvl_1_patients"
  277.                LEFT JOIN main_counters ON mv_stat_lvl_1_patients.id = main_counters.patient_id
  278.                LEFT JOIN groups_counter ON mv_stat_lvl_1_patients.id = groups_counter.patient_id
  279.                LEFT JOIN diagnosis_cnt ON mv_stat_lvl_1_patients.id = diagnosis_cnt.patient_id
  280.       WHERE "mv_stat_lvl_1_patients"."legal_entity_id" = 8575
  281.         AND "mv_stat_lvl_1_patients"."employee_id" = 217911
  282.       ORDER BY mv_stat_lvl_1_patients.full_name ASC) mv_stat_lvl_1_patients
  283. WHERE ("mv_stat_lvl_1_patients"."hypertension_state" IN ('done', 'need_done', 'no_need_done') OR
  284.        "mv_stat_lvl_1_patients"."diabetes_state" IN ('done', 'need_done', 'no_need_done') OR
  285.        "mv_stat_lvl_1_patients"."prostate_cancer_state" IN ('done', 'need_done', 'no_need_done') OR
  286.        "mv_stat_lvl_1_patients"."breast_cancer_state" IN ('done', 'need_done', 'no_need_done') OR
  287.        "mv_stat_lvl_1_patients"."colorectal_cancer_state" IN ('done', 'need_done', 'no_need_done') OR
  288.        "mv_stat_lvl_1_patients"."visits_from_40_to_64_state" IN ('done', 'need_done', 'no_need_done') OR
  289.        "mv_stat_lvl_1_patients"."visits_upper_65_state" IN ('done', 'need_done', 'no_need_done'))
  290. LIMIT 15 OFFSET 0
Advertisement
Add Comment
Please, Sign In to add comment
Advertisement
Public Pastes
Advertisement
We use cookies for various purposes including analytics. By continuing to use Pastebin, you agree to our use of cookies as described in the Cookies Policy.  OK, I Understand
Not a member of Pastebin yet?
Sign Up, it unlocks many cool features!