Anotacija 2000 ženklų

Baltymų ir mažų molekulių sąveikos kompiuterinis modeliavimas
62 molekulių serijai buvo sukurti šeši 5 parametrų QSAR modeliai aprašant jų aktyvumą prieš 3 ląst. linijas. Pasiūlyti modeliai gali būti naudojami atskirti aktyvius junginius nuo neaktyvių ir pagerinti minėtos junginių serijos aktyvumą. Iš šių duomenų parašytas straipsnio skyrelis.
40 karboanhidrazės (CA) II sulfonamidinių slopiklių atlikti palyginamieji skaičiavimai naudojant dokinimą, LIE, metadinamiką ir QSAR. Paskaičiuotos jungimosi konstantos ir palygintos su eksperim. duomenimis siekiant palyginti šių metodų tinkamumą tiriamos CA II/slopiklio sistemos savybėms apskaičiuoti. Iš išbandytų metodų tik QSAR rezultatai buvo visiškai teigiami. Buvo pasiūlyta LIE metodo modifikacija kurią naudojant rezultatai žymiai pagerėjo. Iš šių duomenų parašytas straipsnis.
Yra svarbu surasti slopiklius savitus CA XII izoformai. Tai pačiai serijai 40 CA sulfonamidinių slopiklių tada atlikti QSAR/3D-QSAR skaičiavimai naudojant keturias skirtingas metodikas siekiant prognozuoti slopiklių specifiškumą CA XII lyginant su kitomis CA. Viso 25 QSAR modeliai buvo sukurti. 14 iš jų tinkamumas prognozėms buvo parodytas įvairiais statistiniais metodais. Iš šių duomenų rašomas straipsnis.
Kiekvienai žmogaus metabolito ir DrugBank chem. str. porai buvo paskaičiuotas panašumo Tanimoto įvertis (T). Rasta 2817 itin panašių metabolito ir ligando porų (T > 0,9) su žinomais jungimosi taikiniais. Bent vienas taikinys sutapo 644 junginių porose. Taigi, jei metabolito ir ligando T didesnis kaip 0,9 tai tikimybė, kad jungimosi taikinys sutaps ~23%. Remiantis tuo 13 žmogaus metabolitų kurie yra svarbūs vėžio augime rasta serija panašių junginių galimai turinčių priešvėžinį aktyvumą. Rezultatai patvirtinti eksperim. kitoje laboratorijoje. Vienas iš rastųjų junginių parodė aktyvumą slopinant vėžinių ląstelių augimą; jo taikinys yra prieš tai su vėžiu nesietas fermentas. Iš šių duomenų rašomas straipsnio skyrelis.